Mojn,
safe mode hängt meist mit den Einstellungen des Servers zusammen.
Da kämen jetzt zwei Vermutungen auf.
1. Der Provider hat Safe Mode aktiviert.
In dem Fall mal am besten nachfragen und klären lassen.
2. Die Benutzergruppen Zugriffsrechte für den betroffenen Ordner stimmen plötzlich nicht mehr.
Hast du mal versucht das Update Händisch durchzuführen?
Es könnte ja sein, dass du mit deinem FTP Account eine andere Benutzergruppe hast, als das installierte WP.
Ansonsten wüßte ich da jetzt auch nichts weiter zu.