Offenbar "gehören" die Dateien bei Dir nicht dem FTP-User sondern dem Apache o.ä.
Du kannst versuchen, die Dateien per Apache/PHP zu löschen, lade eine Datei z.B. [FONT=courier new]loeschen.php[/FONT] mit dem Inhalt
in den [FONT=courier new]wp-content[/FONT] Ordner hoch und rufe die Datei via [FONT=courier new]http://deinedomain.de/wp-content/loeschen.php[/FONT] auf.