Die Facebook App ID wird von Shariff Wrapper nur für den Abruf von Share Zahlen von Facebook verwendet, daher befindet sich diese Einstellung auch im Bereich "Statistik" des Plugins. Seitens Facebook wird aber auch mit App ID nicht für alle Seiten ein gültiger Zähler zurückgegeben, siehe z.B. diese Antwort des Pluginautors im Plugin Support Forum.
Mit dem Einbinden einer Facebook App ID in den Quelltext einer Webseite, die dann vom Facebook Scraper analysiert wird, hat das rein gar nichts zu tun. Manche SEO Plugins erlauben eine Eingabe für solche Metadaten oder man verwendet ein Child Theme und fügt es selbst sein. Da (wieder mal) kein Link zur Seite angegeben ist, bleibt alles diesbezüglich ein Ratespiel.