Einfach das Backup wieder aufspielen. Vorher aber erst mal ein weiteres Update der jetzigen Installation erstellen und überprüfen, ob sich das Archiv öffnen lässt (falls ein Zip oder ähnliches gepackt wurde), bzw. prüfen, ob die Dateien vollständig sind.
Backup aufspielen: Alles löschen (Dateien auf FTP) und die Datenbank per phpmyAdmin. Dann die Dateien aus dem Backup per FTP hochladen sowie die *.sql Datei per PHPmyAdmin importieren.
Wenn du kein Backup haben solltest ... das wäre natürlich Mist. Frag beim Hoster nach, vielleicht kann der helfen.
Letzte Option: Warten bis qtranslate ein Update liefert, der Bug ist bekannt. Oder qtranslage deinistallieren, das sollte (hoffentlich) auch die übersetzten Seiten löschen. Mach dieses Mal aber dann vorher ein Backup (Dateien und Daten). Wenn bis zum qtranslate keine neuen Inhalte auf eurer Website erfolgen. spielst du das Backup wieder ein und updatest anschl. qtranslate.