Ich vermute auch einen Denkfehler, leider ist es auch schwer soetwas in kurzen worten zu erklären,
mit nur einem Unterordner finde ich es einfacher(zumindest so wie ich deine Konstellation einschätze). Am einfachsten finde ich persönlich Subdomains. also http://WWW.XY.de als Haupseite und eine subdomain en.xy.de als zweitseite.
Erstmal musst du dir über die Ordnerstruktur im klaren sein, was für Dateien wo liegen, danach muss die Datenbank gemäß des FAQ-Artikels angepasst werden.
Da es sich um ein mehrsprachiges Seite handelt denke ich mal dass es such um ein kommerzielles Projekt handelt, vielleciht findet sich auch jemand in der Jobbörse, sowas ist binnen einer Stunde erledigt für den Profi