Okay, habe das Problem eben gelöst.
Es lag tatsächlich am PHP-Code. Scheinbar stimmte etwas mit der Reihenfolge nicht, außerdem gibt es einige Attribute, die verpflichtend sind, also nicht entfernt werden dürfen.
Der Code sieht jetzt so aus:
PHP
printf( __( '<span class="sep"></span><a href="%1$s" title="%2$s" rel="bookmark"><time class="entry-date" datetime="%3$s" pubdate><div id="zeitangabe">
<div class="day">%4$s</div>
<div class="month">%5$s</div>
<div class="year">%6$s</div>
</div></time></a>', 'toolbox' ),
esc_url( get_permalink() ),
esc_attr( get_the_date( 'd, M, Y' ) ),
esc_attr( get_the_date( 'd, M, Y' ) ),
esc_attr( get_the_date( 'd. ' ) ),
esc_attr( get_the_date( 'M ' ) ),
esc_attr( get_the_date( 'Y' ) )
);
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So wird auch alles richtig angezeigt. Vielleicht wird es ja der ein oder andere mal brauchen.