Falls es noch jemanden interessiert:
Das Problem hatte etwas mit der PHP-Konfiguration beim Webhoster Hetzner zu tun. Dort sind standardmäßig diverese Beschleunigungs-Extensions eingeschaltet. Nachdem ich sie alle ausgeschaltet hatte, traten keine Fehler mehr auf.
Danke, das hat mir weitergeholfen. :D Wenn man sich bei den Extensions auf den eAccelerator beschränkt sollte es keine Probleme geben. Ursache war wohl APC (PHP5).