Ich habe mir NGG gerade mal testweise installiert. Was genau ist denn weg? Galerien und/oder Bilder? Oder wirklich nur Einstellungen? Die Bilder landen offenbar unter wp-content/gallery, die Einstellungen in der wp_options-Tabelle (Keys startend mit "ngg_").
Die NGG-Optionen landen offenbar in einem serialisierten String. genau wüsste ich nicht wie, aber möglich wäre es, dass Du in diesem String Deine Domain ersetzt hast und hast ihn damit zerstört. Vergleiche also mal die Werte von "ngg_options" in der alten und der neuen wp_options-Tabelle. Ansonsten wüsset ich jetzt erstmal nicht, wie da etwas wegkommen sollte.