Links verschwinden einfach 403: Forbidden (Directory index forbidden)

WordPress legt keine Verzeichnisse an, sondern interpretiert die URL-Struktur. Daher ist es seltsam, dass Du für /2006/11/ eine 403 bekommst. Denn eigentlich müsste man unter der URL das Archiv für November 2006 sehen. Wenn es im November 2006 keine Beiträge gäbe, würde WP mit einer Fehlermeldung darauf hinweisen.

Der 403 kann also nur kommen, wenn das Verzeichnis tatsächlich existiert, aber kein index.html oder index.php enthält (und auch auto-indiziert werden soll). Das heißt also, dass es in Deinem root das Verzeichnis /2006/11/ tatsächlich gibt. Da Du nicht weißt, wo es herkommt, wird es wohl automatisch angelegt worden sein. Ich vermute folgendes: Du hast als Upload-Ordner Dein Webroot definiert und zusätzlich die Option gewählt, Uploads nach Jahren und Monaten zu sortieren. Sollte das der Fall sein, solltest Du unbedingt ein anderes (Unter-)Verzeichnis dafür wählen.

Gern geschehen. Nun, wenn es nicht die interne Upload-Funktion war, wird's wohl eine andere Anwendung gewesen sein. Im Übrigen wäre es vielleicht schlau gewesen, einen Blick in den Ordner oder auf den Zeitstempel der Erstellung zu schauen, um rauszufinden, wann er erstellt wurde.