Der Thread ist zwar nicht mehr der neueste aber ich schreib trotzdem mal meine gerade neu gewonnene Erfahrung zu diesem Problem :)
Also bei mir konnte ich jetzt feststellen, dass das Problem auftrat, weil ich in einem anderen Verzeichnis noch ein weiteres Test-Wordpress liegen hatte. Dieses WP benutzte ursprünglich aber die gleiche Datenbank.
Wenn ich jetzt das alte Test-WP mit dem Original Theme aufgerufen habe, wurde sofort auch das Theme beim neuen WP umgeschaltet. Das ganze habe ich ein paar mal hin und her probiert, so dass ich mir zu 99% sicher bin die Ursache (zumindest bei mir) gefunden zu haben.