Theme

Kurz und knapp?
Nö. ;)

Du musst du schon die .php Dateien haben, da die Funktionsaufrufe aus den .php Dateien im geparsten HTML ja nicht enthalten sind.
Man kann allerdings viel aus dem Quelltext entnehmen, wenn man weiß wie man ihn lesen muss, das ist schon wahr.

Wie sich das HTML-Grundgerüst einer Webseite aufbaut, das erfährst Du in jedem besseren HTML5 Tutorial, dazu brauchst Du Dir nicht unbedingt eine mit WordPress gestaltete Webseite zu kopieren. Wie sich das in ein WordPress-Theme dann umsetzen lässt, ist eine andere Frage. Eigentlich gar nicht, wenn man nicht versteht, wie sich ein Theme aufbaut.

Das man viel aus dem Quelltext entnehmen kann, dem möchte ich nicht unbedingt zustimmen, insofern mehr als eine CSS und zusätzliche JavaScripts am Aufbau beteiligt sind. Entferne die Styles und Du hast eine einfache Seite, wo zum Beispiel ein Menü kein Menü mehr ist, sondern nur noch eine einfache Linkliste.