Nach Umzug und Update werden die URLs umgewandelt

Hallo Leute!
Ich habe Wordpress vom Entwicklungsordner zum Root Verzeichnis der gleichen Domain kopiert.
Danach schien alles zu laufen. Dann habe ich auf das aktuelle WP 3.4.2 aktuallisiert.
Auf dem Entwicklungsordner läuft das eigene Template immer noch korrekt.

Jetzt habe ich festgestellt das bei der Kopie auf Root die Links vom Paging nicht mehr gehen.

Die eigentlich Seite ist http://www.url.com/news/
Ich hab den Link erstmal so lange nicht weiß wo das Problem herkommt auf absolut geschrieben.
Also der Href sieht z.B. so aus <a href="http://www.url.com/news/?page=2">2</a>
Nach dem laden der Seite wird die Url in http://www.url.com/news/2 geändert.

.htaccess sieht so aus
# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>
# END WordPress

Permalinks sind in WP so eingestellt
/%postname%/

Ich weiß ehrlich gesagt nicht wo es herkommt. kann mit hoher Wahrscheinlichkeit sein das es .htaccess ist, ich kann aber auch permalinks nicht ausschließen.

Wäre echt genial wenn mir jemand auf die Sprünge helfen könnte, ich bin mit so .htaccess einstellungen völlig aufgeschmissen.

Also das Verzeichnis ist das Root der Domain. Kann ich leider nicht umbennen. Ich habe die Datenbank schon nach alten Pfaden durchgesucht, hat damit auch nicht zu tun, denn ich hab für die Newsseite in PHP mein eigenes Paging geschrieben.
Ich finds halt sehr komisch das er die Url die ich in dem Link für die jeweilige Seite aufrufe umschreibt. Und wie schon gesagt auf der alten Testumgebung auf dem gleichen Server nur mit anderem Verzeichnis funktioniert alles.

achso sorry habs falsch verstanden... also ich hab das mal probiert mit Entwicklerverzeichnis ändern, aber jetzt bekomme ich ein 404.

ok 404 im testordner hab ich behoben war weil ich in wp-config noch 2 difine's drin hatte mit alter url... hab jetzt alles weggemacht geht wieder, aber schlauer bin ich imme rnoch nicht...

Zitat von Armin Heuser

Jetzt habe ich festgestellt das bei der Kopie auf Root die Links vom Paging nicht mehr gehen.

Die eigentlich Seite ist http://www.url.com/news/
Ich hab den Link erstmal so lange nicht weiß wo das Problem herkommt auf absolut geschrieben.
Also der Href sieht z.B. so aus <a href="http://www.url.com/news/?page=2">2</a>
Nach dem laden der Seite wird die Url in http://www.url.com/news/2 geändert.

Ok Thema gelöst ...
Das Problem liegt bei der Variable page!!! <a href="http://www.url.com/news/?page=2">2</a>
Ich hab jetzt ein anderen Variablennamen genommen und es geht wieder!

Ich habe keine Ahnung wie man das Thema als gelöst markiert, bitte als gelöst eintragen!

Und Danke auch an die Mithilfe von bgeissler.