Lass deine Seite doch mal durch einen HTML-Validator (z.B. HTML Tidy) laufen! Ich bekomm' hier schon mal 132 Warnungen ... da ist bestimmt auch die Stelle dabei, die der Fox noch korrekt anzeigt, der IE6 aber nicht.
Das Problem selbst sollte auf den ersten Blick irgend etwas mit deiner div-Klasse "entry" zu tun haben - geh' diesen Teil einfach mal durch und mach' die "besonderen CSS-Einstellungen" für den IE6 erst einmal mit einem führenden "_" (Unterstrich).