Also läuft es zwangsläufig darauf hinaus, dass ich später http://www.domainname.de/domainname/... in den jeweiligen Seiten-URLs stehen habe?
Ich weiß ja nicht, was für einen Hoster Du hast, doch ich habe es bisher noch nicht anders kennengelernt. So viel kenne ich jedoch nun wieder auch nicht. Angenommen, Du hast ein Webpaket mit 4 Inklusiv-Domains, dann kannst Du für jede Domain ein Verzeichnis anlegen und jede Domain halt nur auf das Verzeichnis für diese Domain verweisen lassen.
Welche Server-Software da außer dem Apache für die Verwaltung verwendet wird, davon habe ich keine Ahnung. Da wird es sicherlich Unterschiede geben, ob einige hundert Pakete auf einer Platte liegen oder ob es sich um einen eigenen Server handelt, wo man nur den Eintrag ServerName und DocumentRoot in der vhost.config entsprechend der Einstellungen für jedes Verzeichnis einzeln anzupassen braucht. Da wird sich Hille besser auskennen.
Doch das alles braucht Dich erst einmal nicht zu interessieren, das geht Dir praktisch nichts an, für Dich ist nur wichtig zu wissen, wenn Du eine Domain auf ein Verzeichnis zeigen lässt, ändert sich nichts mit der Domain, die wird weder weitergeleitet noch verlängert die sich, nur die Startseite für diese Domain gehört dann halt in dieses Verzeichnis und alle weiteren Dateien und Unterverzeichnisse, die für die Web-Installation für diese Domain von Bedeutung sind, die gehören da ebenfalls mit hinein.