Ich verwende Kategorien und Unterkategorien, um die Einträge zu strukturieren, und Tags um thematisch zueinander passende Einträge zusammenzufassen.
Beispiel: WP-Website über einen Sportverein mit vielen verschiedenen Sektionen (Hauptkategorien), die wiederum in verschiedene Gruppen oder Mannschaften oder auch nach Spielmodus (Unterkategorien) gegliedert sind. Das entspricht am ehesten einer Ordnerstruktur.
Tags könnte man hier verwenden, um ähnliche Beiträge auch sektionsübergreifend thematisch zu gruppieren, z.B. über den Namen der gegnerischen Mannschaft, Spieljahre, besondere Ereignisse usw.
Tags kann man meiner Meinung nach auch schön nutzen, um die Suchfunktion zu erweitern:
"Leider wurde der von Ihnen gesuchte Begriff nicht gefunden. Versuchen Sie doch eines der folgenden Stichwörter: [Tagcloud]"