Also wenn du deine Templates vernünftig schreibst, dann ist da deutlich mehr als 10% HTML drin. ;-) Ansonsten versteh ich nicht so wirklich, was nun deine eigentliche Frage ist.
Deine HTML-Vorlagen musst du mit den sogenannten Template-Tags füllen:
Template Tags WordPress Codex
Die stellen sozusagen die Schnittstelle zu WP dar und geben die Inhalte des Blogs aus.
Und im Codex gibts auch ne sehr ausführliche Dokumentation der Theme-Architektur:
Theme Development WordPress Codex
Welche Template-Dateien dein Theme benötigt legt die Template-Hierachie fest:
Template Hierarchy WordPress Codex
Im deutschsprachigen Netz findest du sicher auch ne Menge. Da kann ich dir z.B. Monikas Seite empfehlen:
WordPress Theme Vorlage
Ein WordPress Theme entsteht
How To - Design Your Own WordPress Theme