Das hat sicher nichts mit WP 3.9 zu tun -> läuft tausendfach ohne Probleme.
Bist du sicher, dass bei der Installation alles richtig lief?
Im zweifelsfall würde ich WP nochmals drüberinstallieren.
LG
PS: hat WP bei der Intsallation auch die nötigen Tabellen in der Datenbank erstellt?