aber durch das Erneuern fast aller Dateien und Ordner habe ich die Hintertür anscheinend gleich mitgelöscht ...
Wohl kaum, zumal du nicht mal weißt, ob nicht zusätzliche Skripte installiert wurden. Für solche Probleme gibt es normalerweise Professionelle Dienstleister. Erst dann kann man davon ausgehen, das das Problem beseitigt ist.