habs selber gefunden... Falls es jemand hilft:
In der index.php:
<?php
$page = (get_query_var('paged')) ? get_query_var('paged') : 1;
query_posts("cat=-16,-4&paged=$page&posts_per_page=9"); ?>
müssen die Kategorien die nicht aufgeführt werden können ausgeschlossen werden.