Hast Du denn den Multisite-Modus aktiviert? Da kannst Du ja die Plugins als Administrator aktualisieren/updaten, was dann für alle Blogs gilt. Auch ob Du ein Plugin für alle aktivierst oder ob die einzelnen Blog-Admins diese für ihr Blog individuell aktivieren können, kannst Du festlegen.
Allerdings ist mir auch keine Methode bekannt, um die Plugin-Einstellungen in allen Blogs zu ändern. Aber da gibt es sicher einige Cracks, die das auch unter Kontrolle haben. Immerhin läuft wordpress.com vermutlich mit mehreren Tausend Blogs...