Manuelle Menüs unterscheiden sich von automatischen Menüs dadurch, daß man alles selbst festlegen und bei Bedarf auch wieder hinzufügen muß.
Automatische Menüs stellen einfach jede Hauptseite ohne Zutun als Menüpunkt dar, wenn man eine solche veröffentlicht hat.
Wer also automatische Menüs möchte, kann den Code verwenden, den ich veröffentlicht habe. Zum Thema Einfügen in die functions.php ist die sicherste Stelle dazu, wenn man keinen Plan von PHP hat, das erste öffnende PHP Inlay zu suchen, das man daran erkennt:
Direkt danach (Leerzeichen schon noch dazwischen) funktioniert es auf jeden Fall.