Lösche nicht einfach Tabellen in der Datenbank von Hand. Damit würdest Du tatsächlich deinem Projekt eher schaden als helfen.
Ich würde stattdessen folgende zwei Dinge empfehlen:
a) Schau dir die Liste deiner Plugins an. Sind dort inaktive dabei die du wirklich nie mehr nutzen willst? Dann lösche sie über den entsprechenden Link. Dadurch sollte die Uninstall-Routine des Plugins auch seine Daten aus der Datenbank löschen.
b) Installiere dir das Plugin https://de.wordpress.org/plugins/wp-optimize/ - dort kannst Du die Datenbanktabellen auflisten lassen und siehst, welche nicht mehr genutzt werden. Du kannst sie hier auch direkt entfernen.
Bei jeder Änderung dran denken vorher ein Backup zu erstellen.